Q: 削除されてなくて、順位が落ちただけでも手動によるペナルティーを受けている可能性はあるのでしょうか？

Ａ：

順位の落ち方によります。
順位の落ち方が40位以上の場合は手動によるペナルティーの可能性があります。

順位の落ち方が5位から10位程度なら手動によるペナルティーではなく、コンテンツ不足か、コンテンツの独自性が無い場合が多いです。

対策としては、目標キーワードがしつこくない程度に含まれたオリジナル文章を数百文字以上追加することと、順位が落ちたページに書かれている文章が他のウェブページと同じか、似ていないかを確認して下さい。

他のウェブページと同じか、似ている場合は、文章をオリジナル文章になるように書き直さなくてはなりません。