Q: ハイライト表示 Ctrl+Fはソース表示で確認した方がよいか、それともHPの通常見る状態で確認したほうがよいか、どちらでしょうか？

Ａ：

基本的にはソースで確認して下さい。

Googleはソースでページを評価するからです。

ただし、最近ではユーザーが見た時、つまりブラウザーで見た場合不自然なキーワードの書き方をしてるとペナルティーを与えられるようにもなっているので順位が上がらないページはソースだけではなく、HPを通常見る状態であるブラウザーでも確認して下さい。