Q: ドメインの種類によって検索に有利・不利はありますか？

たとえば、.tokyoなどマイナードメインに比べ、co.jpや.comなどが有利など。

Ａ：

まったくありません。どれでも評価は同じです。
Googleはそうした基準でサイトを評価するような不公平なことはしていません。
ただし、人が見たときの印象というものがあるので、極力珍しいドメインの種類は使わないほうが良いと思います。