Q: ドメインのことでアドバイスをお願いします。

集約するなら、どれかのドメインを引き継ぐのか、また新しく作成するかも決めかねております。
現状の各分院ドメインの被リンク状況はどの病院も基本的には法人間サイトのリンクと、お付き合いのある病院様とのリンクというのが基本で、権威の或る行政機関や大学病院サイトからの被リンクはありません。チラホラ個人サイトからのリンクがあるサイトはあるという状態です。

Ａ：

いくつかの分院のサイトを引っ越しするときの引越し先は、通常院のオフィシャルサイト（またはメインサイト）です。理由はオフィシャルサイトは通常権威性の高いサイト、信頼性の高いサイトからリンクを張ってもらっていたり、サイト運用歴が長かったり、Google自然検索結果からの過去の流入数が最も多い傾向があるからです。

そうした理由もあり、２０１９年の３月１２日や６日３日のコアアップデート実施以降はオフィシャルサイトばかりが上位表示するようになってきています。特に医療の分野はその傾向が顕著です。